生命科学:代算及培训等技术需求采集表
有关软件版权的温馨提示:

1、代算只是技术服务,如果有人说通过代算就能解决版权,那要不您遇到了骗子,要不对方对版权概念根本不了解,谨防上当受骗。
2、有关版权,可致电18911931394(VX),十几年的经验能给您提供最专业的咨询及解决方案。

您的代算或培训需求描述
1、代算:务必详细描述您想计算的结构、性质、精度、数量等。请您尽量详细,这样咱们的沟通会更加高效,多谢您! 2、培训:可参考下方内容列出,或DIY描述需求。
您的结构或文献上传
若手机不方便,请通过网页端上传https://cn.bigin.online/org40708307/forms/newform-ls
您预算的大概费用
您的单位名称
请写全称,不要写简称,最好能精确到学院,多谢您
您的姓名
您的职位/职称
方便请列出:硕士、博士、老师、企业研究员等,多谢您!
您的手机
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您期望完成的日期
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Discovery Studio软件-药物设计培训内容:

a.基于受体结构对药物进行片段生长;
b.基于受体结构对药物进行骨架跃迁;
c.基于受体结构通过linker连接药物片段;
d.使用基于 MM-PBSA 或 MM-GBSA CHARMm 的方法计算结合能;
e.通过FEP准确预测同类配体系列的相对配体结合能;
f.计算由多位点 Lambda 动力学 (MSLD) 建模的配体组合库的相对结合自由能;
g.将数据与经典QSAR或3D-QSAR与分子指纹等描述符相结合创建预测模型;
h.使用ADME和TOPKAT最大限度地降低毒性并优化药代动力学特征

Discovery Studio软件-分子动力学模拟培训内容:

a.通过charmm, NAMD执行显式溶剂或隐式溶剂能量最小化和分子动力学模拟;
b.使用混合量子力学/分子力学 (QM/MM) 模拟计算单点能量或执行受体-配体复合物的最小化;
c.通过GaMD同时进行无约束增强采样和自由能计算;

Discovery Studio软件-虚拟筛选培训内容:

a.通过LibDock,CDOCKER或MCSS对接方法对化合物库进行配体或片段的虚拟筛选;
b.通过HipHop或HypoGen药效团建模方法对化合物库进行配体或片段的虚拟筛选;
c.通过药物五规则和PAINS规则或您自定义的标准过滤或PCA聚类候选配体库;
d.通过化学反应或核心枚举构建并使用帕累托优化、多样性和相似性分析来优化组合库;
e.使用 PharmaDB 数据库探索脱靶活性和药物再利用;

Discovery Studio软件-抗体设计培训内容:

a.抗体序列注释、比对及自动化构建高质量的结构模型;
b.使用ZDOCK进行抗体-抗原对接,识别作用残基和构象灵活性;
c.基于温度或pH的突变稳定性和结合亲和力预测或确定潜在的稳定二硫桥位置;
d.不影响抗体稳定性或功效的情况下预测抗体人源化的残基突变;
e.基于SCM和SAP计算抗体溶解度、粘度、可开发性及PTM;

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